小福、小吉的好伙伴天天、年年、月月三神兽回到天庭，猪怪被放回凡间，并被猪八戒授命寻找一种名为“百仙株”的仙草。三七镇流感来袭，依伯一病不起，在三神兽地指引下，小福等人找到了世外隐居者修道人，并得知要完全治愈依伯的病需要一种名为“百仙株”的植物。小福便寻找“百仙株”的线索，海盗抓走在海边玩耍的钱进宝，小福、衙门、猪怪三方联手击退海盗。小福意外得知“百仙株”长在一座名为‘仙株岛“的小岛上。小福毅然决定出海却遭到众人地反对。小福从依伯口中得知自己还有一失踪在海上的孪生兄弟，大惊不已。经过一番波折，三七镇人为小福制造了一艘航船，小福、榕榕、小吉成功出海，猪怪和手下也驾船出发。众人在海上冒险，与海盗多次交手，先后经过劲浪湾、风雨泊等，海盗队长海台的意外出现令小福震惊，两人对决时，旋风将小福、海台等人吹到一座神秘岛屿遇到那里的细菌三兄弟。小福、海台等人各自使用自己的方法离开神秘岛重归航线，小福和海台给对方留下深刻印象。行途中，榕榕病倒，小福经过黑暗隧道领悟修道人送给他的武学秘籍，小福与猪怪六人来到观仙台，在观仙台主人慈航渡地指引下，众人明确了仙株岛位置。 小福、猪怪等人和海台海盗两个队伍同时到达仙株岛。在仙株岛外围迷宫队伍分散，最终小福和海台两人进入仙株岛内，两人大战，最后双方平手，此时，两人身上的半块玉发出光芒，两人意识到对方就是自己的亲兄弟，这时仙株岛开始全面崩塌。海台带着小福逃到海盗船上，所有人也都在船上等候。海台宣告失败，下令无效后被迫离开，两个海盗这时展现出他们真正的实力，小福猪怪等六人联手也毫无胜算，关键时刻三神兽下凡，在众人的努力下终于击退俩海盗。最后，小福等人借着三神兽的魔法回到三七镇，治好了依伯的病。猪怪高兴地收下了另一半没用上的百仙株，而海台和海盗却在一个神秘地点被一个神秘男子训斥。